Marzo 2, 2020
Il microbioma orale è stato oggetto di studi di crowd-sourced
Il microbioma orale – la somma totale di microrganismi, compresi batteri e funghi, che occupano la bocca umana – è stato oggetto di uno studio condotto dalla crowd-sourced e guidato dal laboratorio di ricerca di Jessica Metcalf presso CSU e dal gruppo di ricerca di Nicole Garneau presso Denver Museum of Nature & Science. Pubblicato in Scientific Reports, lo studio ha trovato, tra le altre cose, una correlazione tra persone che non visitavano regolarmente il dentista e aumentava la presenza di un patogeno che causa la malattia parodontale.
Per gli esperimenti, condotti dal team scientifico della comunità di Garneau nel Genetics of Taste Lab presso il museo, un’ampia sezione di visitatori del museo si è sottoposta a un tampone di guance e ha risposto a semplici domande sulla loro demografia, stili di vita e abitudini di salute. I dati di sequenziamento del DNA microbico analizzati dal gruppo Metcalf hanno rivelato, in generale, che le abitudini di salute orale influenzano le comunità di batteri nella bocca. Lo studio ha sottolineato la necessità di pensare alla salute orale in quanto fortemente legata alla salute di tutto il corpo.
“Il nostro studio ha anche dimostrato che il crowdsourcing e l’utilizzo di scienziati della comunità possono essere davvero un ottimo modo per ottenere questo tipo di dati, senza dover ricorrere a studi di grandi dimensioni controllati da casi”, ha affermato Zach Burcham, ricercatore post dottorato e autore principale del documento. L’autore senior Metcalf è professore associato presso il Dipartimento di Scienze animali e membro della rete di microbiomi della CSU.
Tamponi sulle guance
Nel 2015, la co-autrice di carta Garneau e il suo team hanno formato scienziati volontari cittadini per utilizzare grandi tamponi per raccogliere le guance dai visitatori del museo – una popolazione naturalmente diversa – che hanno acconsentito allo studio. Questi scienziati cittadini addestrati hanno contribuito a raccogliere i tamponi da 366 individui – 181 adulti e 185 giovani di età compresa tra 8 e 17 anni.
L’impulso originale per lo studio era di determinare se e in che misura il microbioma orale contribuisse al modo in cui le persone assaggiano le cose dolci. Nel raccogliere questi dati, che sono stati anche riportati nel documento, i ricercatori hanno notato punti di dati più significativi sulle abitudini di salute orale.
Per aiutare a tradurre i dati, Garneau si è rivolto al team di esperti di Metcalf alla CSU. Burcham e gli scienziati del microbioma hanno utilizzato sofisticati strumenti di sequenziamento e analisi per determinare quali microbi erano presenti in quali bocche. Il sequenziamento dei dati è stato eseguito in collaborazione con scienziati del gruppo di Rob Knight presso l’Università della California di San Diego. Un team di nutrizione della Michigan State University ha anche apportato competenze sull’importanza delle relazioni materne e infantili per l’analisi dei dati.
“Insieme, abbiamo avuto un team da sogno per utilizzare la scienza della comunità per rispondere a domande complicate sulla salute e la nutrizione umana, utilizzando sequenze e analisi microbiche all’avanguardia”, ha detto Garneau.
Filo interdentale e cure dentistiche regolari
Lo studio ha raggruppato persone che hanno usato il filo interdentale o non hanno usato il filo interdentale (quasi tutti hanno dichiarato di aver spazzolato, quindi non era un punto dati utile). I partecipanti al filo interdentale hanno scoperto di avere una minore diversità microbica in bocca rispetto ai non-filo interdentale. Ciò è probabilmente dovuto alla rimozione fisica di batteri che potrebbero causare infiammazione o malattia.
Gli adulti che erano andati da un dentista negli ultimi tre mesi avevano una diversità microbica complessiva inferiore nella bocca rispetto a quelli che non erano andati in 12 mesi o più, e avevano meno del patogeno orale parodontale che causa la malattia, Treponema. Questo, ancora una volta, era probabilmente dovuto alla pulizia dentale che rimuoveva i taxa batterici più rari in bocca. I giovani hanno avuto una visita dentale più recentemente degli adulti.
I microbiomi giovanili differivano tra maschi e femmine e in base al peso. I bambini considerati obesi in base ai loro indici di massa corporea avevano microbiomi distinti rispetto ai bambini non obesi. I bambini obesi tendevano anche ad avere livelli più alti di Treponema, lo stesso patogeno trovato negli adulti che non erano stati dal dentista per più di un anno. In altre parole, i ricercatori hanno visto un possibile legame tra obesità infantile e malattia parodontale. “Questo è stato molto interessante per me, che siamo stati in grado di rilevare questi dati in una popolazione così generale, con un gruppo di persone così variabile”, ha detto Burcham.
Altri dati scoperti: i microbiomi dei partecipanti più giovani, principalmente nella fascia di età compresa tra 8 e 9 anni, presentavano una maggiore diversità rispetto a quelli degli adulti. Tuttavia, i microbiomi adulti variavano più ampiamente da persona a persona. I ricercatori pensano che ciò sia dovuto al fatto che gli ambienti e le diete degli adulti sono più ampi rispetto ai bambini.
Hanno anche visto che le persone che vivevano nella stessa famiglia condividevano microbiomi orali simili.
“Quando guardi le famiglie che vivono insieme, scopri che condividono più di quei rari taxa, i batteri che non si trovano così spesso in abbondanze più elevate”, ha spiegato Burcham. Era un punto dati che sottolineava l’importanza del proprio ambiente costruito in relazione alle comunità microbiche nei nostri corpi.
Lavorare sullo studio orale è stato affascinante, anche se al di fuori del normale scopo di Burcham; di solito si concentra sullo studio dell’ecologia microbica della decomposizione.
“Penso che le nostre vite siano essenzialmente guidate dai nostri microbiomi e influenzate dai nostri microbiomi, è interessante, indipendentemente dal sistema che stiamo osservando”, ha affermato Burcham.
Lo studio è stato reso possibile da un Science Partnership Partnership Award del National Institute of General Medical Sciences, National Institutes of Health (Award # R250D021909).
Materiale fornito dalla Colorado State University. Originale scritto da Anne Manning.
Riferimenti:
- Zachary M. Burcham, Nicole L. Garneau, Sarah S. Comstock, Robin M. Tucker, Rob Knight, Jessica L. Metcalf. Patterns of Oral Microbiota Diversity in Adults and Children: A Crowdsourced Population Study. Scientific Reports, 2020; 10 (1) DOI: 10.1038/s41598-020-59016-0
Colorado State University. “The microbes in your mouth, and a reminder to floss and go to the dentist: Oral microbiome was subject of crowd-sourced study.” ScienceDaily. ScienceDaily, 2 March 2020. <www.sciencedaily.com/releases/2020/03/200302162248.htm>.